مراحل تحقیق و تدوین دانشنامه احادیث طبی شامل جمعآوری احادیث مرتبط با بدن و طب از متون دینی، تنظیم و تکمیل آنها، ارجاع به منابع و تخریج، بازبینی و نقد متن، و تهیه مدخلها و تحلیلهای لازم بود. در نگارش احادیث، متن معتبرترین و جامعترین روایت انتخاب شد و با توجه به دیدگاه اهل بیت علیهمالسلام، احادیث نقلشده، در واقع سخن پیامبر و خدا محسوب گردید.